Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms