Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXF1Q12946 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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