Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LMAN2Q12907 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LMAN2Q12907 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LMAN2Q12907 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LMAN2Q12907 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LMAN2Q12907 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LMAN2Q12907 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LMAN2Q12907 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMAN2Q12907 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMAN2Q12907 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMAN2Q12907 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMAN2Q12907 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMAN2Q12907 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMAN2Q12907 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMAN2Q12907 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMAN2Q12907 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMAN2Q12907 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMAN2Q12907 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
LMAN2Q12907 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMAN2Q12907 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
LMAN2Q12907 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMAN2Q12907 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMAN2Q12907 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMAN2Q12907 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMAN2Q12907 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMAN2Q12907 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMAN2Q12907 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMAN2Q12907 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMAN2Q12907 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMAN2Q12907 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMAN2Q12907 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMAN2Q12907 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMAN2Q12907 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMAN2Q12907 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMAN2Q12907 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMAN2Q12907 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMAN2Q12907 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMAN2Q12907 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LMAN2Q12907 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LMAN2Q12907 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LMAN2Q12907 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LMAN2Q12907 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LMAN2Q12907 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LMAN2Q12907 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LMAN2Q12907 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LMAN2Q12907 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LMAN2Q12907 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LMAN2Q12907 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LMAN2Q12907 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LMAN2Q12907 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LMAN2Q12907 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LMAN2Q12907 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LMAN2Q12907 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LMAN2Q12907 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LMAN2Q12907 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
LMAN2Q12907 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
LMAN2Q12907 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LMAN2Q12907 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LMAN2Q12907 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
LMAN2Q12907 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
LMAN2Q12907 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LMAN2Q12907 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LMAN2Q12907 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LMAN2Q12907 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LMAN2Q12907 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LMAN2Q12907 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMAN2Q12907 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMAN2Q12907 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMAN2Q12907 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMAN2Q12907 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMAN2Q12907 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMAN2Q12907 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMAN2Q12907 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMAN2Q12907 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMAN2Q12907 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMAN2Q12907 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMAN2Q12907 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMAN2Q12907 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMAN2Q12907 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMAN2Q12907 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMAN2Q12907 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMAN2Q12907 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMAN2Q12907 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMAN2Q12907 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
LMAN2Q12907 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
LMAN2Q12907 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMAN2Q12907 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMAN2Q12907 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMAN2Q12907 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMAN2Q12907 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMAN2Q12907 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMAN2Q12907 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMAN2Q12907 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMAN2Q12907 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMAN2Q12907 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMAN2Q12907 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMAN2Q12907 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMAN2Q12907 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
LMAN2Q12907 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMAN2Q12907 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
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