Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RAB40BQ12829 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB40BQ12829 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB40BQ12829 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB40BQ12829 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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RAB40BQ12829 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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RAB40BQ12829 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB40BQ12829 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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RAB40BQ12829 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB40BQ12829 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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RAB40BQ12829 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB40BQ12829 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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