Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC173Q0VFZ6 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms