Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms