Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms