Protein–RNA interactions for Protein: Q06455

RUNX1T1, Protein CBFA2T1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1T1Q06455 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RUNX1T1Q06455 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RUNX1T1Q06455 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RUNX1T1Q06455 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RUNX1T1Q06455 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RUNX1T1Q06455 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RUNX1T1Q06455 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RUNX1T1Q06455 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RUNX1T1Q06455 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RUNX1T1Q06455 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RUNX1T1Q06455 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RUNX1T1Q06455 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RUNX1T1Q06455 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RUNX1T1Q06455 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RUNX1T1Q06455 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RUNX1T1Q06455 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RUNX1T1Q06455 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RUNX1T1Q06455 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RUNX1T1Q06455 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RUNX1T1Q06455 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RUNX1T1Q06455 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RUNX1T1Q06455 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RUNX1T1Q06455 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RUNX1T1Q06455 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RUNX1T1Q06455 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX1T1Q06455 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX1T1Q06455 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX1T1Q06455 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX1T1Q06455 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX1T1Q06455 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX1T1Q06455 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX1T1Q06455 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX1T1Q06455 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX1T1Q06455 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX1T1Q06455 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX1T1Q06455 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX1T1Q06455 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX1T1Q06455 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX1T1Q06455 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX1T1Q06455 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX1T1Q06455 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX1T1Q06455 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX1T1Q06455 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX1T1Q06455 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX1T1Q06455 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX1T1Q06455 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX1T1Q06455 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX1T1Q06455 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX1T1Q06455 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX1T1Q06455 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX1T1Q06455 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX1T1Q06455 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX1T1Q06455 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX1T1Q06455 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX1T1Q06455 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX1T1Q06455 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX1T1Q06455 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RUNX1T1Q06455 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RUNX1T1Q06455 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RUNX1T1Q06455 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RUNX1T1Q06455 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RUNX1T1Q06455 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RUNX1T1Q06455 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RUNX1T1Q06455 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RUNX1T1Q06455 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RUNX1T1Q06455 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RUNX1T1Q06455 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms