Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN12Q05209 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms