Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.7■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
EXOSC10Q01780 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms