Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MS4A2Q01362 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms