Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
FANCCQ00597 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms