Protein–RNA interactions for Protein: P61204

ARF3, ADP-ribosylation factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3P61204 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARF3P61204 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARF3P61204 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARF3P61204 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARF3P61204 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARF3P61204 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARF3P61204 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ARF3P61204 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARF3P61204 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ARF3P61204 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARF3P61204 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARF3P61204 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARF3P61204 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ARF3P61204 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARF3P61204 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARF3P61204 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARF3P61204 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARF3P61204 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ARF3P61204 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARF3P61204 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARF3P61204 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARF3P61204 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARF3P61204 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARF3P61204 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARF3P61204 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ARF3P61204 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARF3P61204 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARF3P61204 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARF3P61204 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARF3P61204 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARF3P61204 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARF3P61204 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARF3P61204 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARF3P61204 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARF3P61204 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARF3P61204 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARF3P61204 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARF3P61204 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARF3P61204 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARF3P61204 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ARF3P61204 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARF3P61204 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ARF3P61204 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARF3P61204 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARF3P61204 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARF3P61204 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ARF3P61204 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARF3P61204 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARF3P61204 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARF3P61204 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARF3P61204 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARF3P61204 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ARF3P61204 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARF3P61204 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARF3P61204 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARF3P61204 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARF3P61204 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARF3P61204 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARF3P61204 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARF3P61204 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARF3P61204 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARF3P61204 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARF3P61204 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARF3P61204 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARF3P61204 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARF3P61204 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARF3P61204 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARF3P61204 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARF3P61204 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARF3P61204 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARF3P61204 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARF3P61204 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARF3P61204 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARF3P61204 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARF3P61204 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ARF3P61204 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARF3P61204 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARF3P61204 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARF3P61204 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARF3P61204 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARF3P61204 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARF3P61204 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARF3P61204 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARF3P61204 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARF3P61204 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARF3P61204 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARF3P61204 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARF3P61204 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARF3P61204 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARF3P61204 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARF3P61204 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARF3P61204 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARF3P61204 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARF3P61204 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARF3P61204 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARF3P61204 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARF3P61204 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARF3P61204 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARF3P61204 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARF3P61204 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms