Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GJA9P57773 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GJA9P57773 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GJA9P57773 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GJA9P57773 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
GJA9P57773 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GJA9P57773 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GJA9P57773 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GJA9P57773 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GJA9P57773 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GJA9P57773 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GJA9P57773 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GJA9P57773 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GJA9P57773 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GJA9P57773 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GJA9P57773 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GJA9P57773 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
GJA9P57773 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GJA9P57773 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GJA9P57773 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GJA9P57773 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GJA9P57773 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GJA9P57773 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GJA9P57773 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GJA9P57773 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GJA9P57773 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GJA9P57773 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GJA9P57773 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GJA9P57773 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GJA9P57773 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GJA9P57773 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
GJA9P57773 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GJA9P57773 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GJA9P57773 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GJA9P57773 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GJA9P57773 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GJA9P57773 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GJA9P57773 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GJA9P57773 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GJA9P57773 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GJA9P57773 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GJA9P57773 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GJA9P57773 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
GJA9P57773 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GJA9P57773 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
GJA9P57773 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GJA9P57773 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GJA9P57773 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GJA9P57773 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GJA9P57773 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
GJA9P57773 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GJA9P57773 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GJA9P57773 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GJA9P57773 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GJA9P57773 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GJA9P57773 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GJA9P57773 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
GJA9P57773 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GJA9P57773 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GJA9P57773 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GJA9P57773 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GJA9P57773 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GJA9P57773 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GJA9P57773 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GJA9P57773 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GJA9P57773 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GJA9P57773 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GJA9P57773 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GJA9P57773 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GJA9P57773 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
GJA9P57773 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GJA9P57773 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GJA9P57773 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
GJA9P57773 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GJA9P57773 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GJA9P57773 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GJA9P57773 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GJA9P57773 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
GJA9P57773 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
GJA9P57773 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
GJA9P57773 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
GJA9P57773 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GJA9P57773 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GJA9P57773 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GJA9P57773 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GJA9P57773 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GJA9P57773 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GJA9P57773 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GJA9P57773 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GJA9P57773 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GJA9P57773 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GJA9P57773 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GJA9P57773 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GJA9P57773 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GJA9P57773 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GJA9P57773 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GJA9P57773 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GJA9P57773 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GJA9P57773 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GJA9P57773 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms