Protein–RNA interactions for Protein: P53803

POLR2K, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2KP53803 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
POLR2KP53803 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
POLR2KP53803 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
POLR2KP53803 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
POLR2KP53803 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
POLR2KP53803 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
POLR2KP53803 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
POLR2KP53803 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
POLR2KP53803 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
POLR2KP53803 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
POLR2KP53803 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
POLR2KP53803 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
POLR2KP53803 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
POLR2KP53803 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
POLR2KP53803 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
POLR2KP53803 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
POLR2KP53803 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
POLR2KP53803 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
POLR2KP53803 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
POLR2KP53803 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
POLR2KP53803 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
POLR2KP53803 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
POLR2KP53803 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
POLR2KP53803 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
POLR2KP53803 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
POLR2KP53803 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
POLR2KP53803 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
POLR2KP53803 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
POLR2KP53803 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
POLR2KP53803 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
POLR2KP53803 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
POLR2KP53803 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
POLR2KP53803 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
POLR2KP53803 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
POLR2KP53803 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
POLR2KP53803 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
POLR2KP53803 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
POLR2KP53803 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
POLR2KP53803 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
POLR2KP53803 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
POLR2KP53803 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
POLR2KP53803 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
POLR2KP53803 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
POLR2KP53803 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
POLR2KP53803 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
POLR2KP53803 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
POLR2KP53803 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
POLR2KP53803 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
POLR2KP53803 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
POLR2KP53803 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
POLR2KP53803 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
POLR2KP53803 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
POLR2KP53803 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
POLR2KP53803 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
POLR2KP53803 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
POLR2KP53803 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
POLR2KP53803 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
POLR2KP53803 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
POLR2KP53803 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
POLR2KP53803 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
POLR2KP53803 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
POLR2KP53803 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
POLR2KP53803 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
POLR2KP53803 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLR2KP53803 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLR2KP53803 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLR2KP53803 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLR2KP53803 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLR2KP53803 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLR2KP53803 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLR2KP53803 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLR2KP53803 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLR2KP53803 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLR2KP53803 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLR2KP53803 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLR2KP53803 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLR2KP53803 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLR2KP53803 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLR2KP53803 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLR2KP53803 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLR2KP53803 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLR2KP53803 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLR2KP53803 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLR2KP53803 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLR2KP53803 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
POLR2KP53803 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLR2KP53803 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLR2KP53803 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLR2KP53803 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLR2KP53803 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLR2KP53803 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLR2KP53803 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLR2KP53803 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLR2KP53803 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLR2KP53803 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLR2KP53803 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLR2KP53803 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLR2KP53803 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLR2KP53803 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLR2KP53803 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms