Protein–RNA interactions for Protein: P51957

NEK4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, humanhuman

Predictions only

Length 841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK4P51957 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEK4P51957 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEK4P51957 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEK4P51957 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEK4P51957 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEK4P51957 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEK4P51957 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEK4P51957 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEK4P51957 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEK4P51957 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEK4P51957 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEK4P51957 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEK4P51957 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEK4P51957 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEK4P51957 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEK4P51957 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEK4P51957 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEK4P51957 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NEK4P51957 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEK4P51957 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEK4P51957 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEK4P51957 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEK4P51957 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEK4P51957 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEK4P51957 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEK4P51957 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEK4P51957 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEK4P51957 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEK4P51957 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEK4P51957 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEK4P51957 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEK4P51957 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEK4P51957 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEK4P51957 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NEK4P51957 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEK4P51957 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEK4P51957 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEK4P51957 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEK4P51957 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEK4P51957 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NEK4P51957 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEK4P51957 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEK4P51957 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEK4P51957 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEK4P51957 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEK4P51957 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEK4P51957 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEK4P51957 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEK4P51957 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEK4P51957 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEK4P51957 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEK4P51957 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEK4P51957 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEK4P51957 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEK4P51957 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEK4P51957 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEK4P51957 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEK4P51957 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEK4P51957 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEK4P51957 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEK4P51957 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NEK4P51957 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEK4P51957 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEK4P51957 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEK4P51957 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEK4P51957 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEK4P51957 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEK4P51957 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEK4P51957 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEK4P51957 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEK4P51957 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEK4P51957 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEK4P51957 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEK4P51957 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEK4P51957 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEK4P51957 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEK4P51957 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEK4P51957 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEK4P51957 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEK4P51957 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NEK4P51957 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
NEK4P51957 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NEK4P51957 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NEK4P51957 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NEK4P51957 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NEK4P51957 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NEK4P51957 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NEK4P51957 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NEK4P51957 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NEK4P51957 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEK4P51957 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEK4P51957 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEK4P51957 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEK4P51957 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEK4P51957 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEK4P51957 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEK4P51957 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEK4P51957 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEK4P51957 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEK4P51957 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms