Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB28P51157 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB28P51157 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB28P51157 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB28P51157 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB28P51157 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB28P51157 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB28P51157 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB28P51157 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB28P51157 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB28P51157 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB28P51157 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB28P51157 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB28P51157 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB28P51157 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB28P51157 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB28P51157 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
RAB28P51157 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
RAB28P51157 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB28P51157 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB28P51157 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB28P51157 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB28P51157 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB28P51157 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB28P51157 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB28P51157 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB28P51157 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB28P51157 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB28P51157 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB28P51157 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB28P51157 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB28P51157 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB28P51157 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB28P51157 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB28P51157 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB28P51157 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB28P51157 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB28P51157 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB28P51157 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB28P51157 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB28P51157 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB28P51157 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB28P51157 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB28P51157 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB28P51157 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB28P51157 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB28P51157 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB28P51157 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB28P51157 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB28P51157 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB28P51157 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB28P51157 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB28P51157 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB28P51157 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB28P51157 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB28P51157 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB28P51157 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB28P51157 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB28P51157 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB28P51157 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB28P51157 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB28P51157 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB28P51157 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB28P51157 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB28P51157 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB28P51157 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB28P51157 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB28P51157 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB28P51157 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB28P51157 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB28P51157 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB28P51157 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB28P51157 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB28P51157 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB28P51157 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB28P51157 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB28P51157 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB28P51157 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB28P51157 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB28P51157 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB28P51157 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB28P51157 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB28P51157 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB28P51157 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB28P51157 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB28P51157 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB28P51157 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB28P51157 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB28P51157 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB28P51157 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB28P51157 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB28P51157 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB28P51157 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB28P51157 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB28P51157 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB28P51157 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB28P51157 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB28P51157 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB28P51157 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB28P51157 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms