Protein–RNA interactions for Protein: P50458

LHX2, LIM/homeobox protein Lhx2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX2P50458 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LHX2P50458 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LHX2P50458 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LHX2P50458 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LHX2P50458 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LHX2P50458 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LHX2P50458 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LHX2P50458 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LHX2P50458 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LHX2P50458 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LHX2P50458 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LHX2P50458 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LHX2P50458 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LHX2P50458 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LHX2P50458 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LHX2P50458 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LHX2P50458 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LHX2P50458 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LHX2P50458 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LHX2P50458 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LHX2P50458 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LHX2P50458 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LHX2P50458 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LHX2P50458 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LHX2P50458 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LHX2P50458 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LHX2P50458 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LHX2P50458 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LHX2P50458 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LHX2P50458 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LHX2P50458 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LHX2P50458 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LHX2P50458 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LHX2P50458 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LHX2P50458 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LHX2P50458 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LHX2P50458 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LHX2P50458 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LHX2P50458 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LHX2P50458 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LHX2P50458 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LHX2P50458 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LHX2P50458 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LHX2P50458 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LHX2P50458 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LHX2P50458 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LHX2P50458 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LHX2P50458 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LHX2P50458 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LHX2P50458 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LHX2P50458 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LHX2P50458 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LHX2P50458 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LHX2P50458 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LHX2P50458 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LHX2P50458 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LHX2P50458 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LHX2P50458 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LHX2P50458 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LHX2P50458 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LHX2P50458 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LHX2P50458 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LHX2P50458 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LHX2P50458 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
LHX2P50458 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LHX2P50458 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LHX2P50458 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LHX2P50458 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LHX2P50458 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LHX2P50458 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LHX2P50458 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LHX2P50458 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LHX2P50458 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LHX2P50458 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LHX2P50458 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LHX2P50458 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LHX2P50458 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LHX2P50458 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LHX2P50458 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LHX2P50458 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LHX2P50458 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LHX2P50458 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LHX2P50458 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LHX2P50458 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LHX2P50458 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LHX2P50458 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LHX2P50458 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LHX2P50458 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LHX2P50458 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LHX2P50458 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LHX2P50458 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LHX2P50458 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LHX2P50458 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LHX2P50458 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LHX2P50458 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LHX2P50458 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LHX2P50458 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LHX2P50458 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LHX2P50458 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LHX2P50458 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms