Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

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Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATRXP46100 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATRXP46100 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ATRXP46100 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATRXP46100 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATRXP46100 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ATRXP46100 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATRXP46100 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATRXP46100 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATRXP46100 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ATRXP46100 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ATRXP46100 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATRXP46100 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATRXP46100 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATRXP46100 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATRXP46100 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATRXP46100 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ATRXP46100 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATRXP46100 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATRXP46100 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATRXP46100 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATRXP46100 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATRXP46100 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATRXP46100 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATRXP46100 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATRXP46100 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ATRXP46100 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATRXP46100 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATRXP46100 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ATRXP46100 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ATRXP46100 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ATRXP46100 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATRXP46100 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATRXP46100 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATRXP46100 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATRXP46100 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATRXP46100 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ATRXP46100 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATRXP46100 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATRXP46100 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATRXP46100 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATRXP46100 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ATRXP46100 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATRXP46100 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATRXP46100 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATRXP46100 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATRXP46100 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATRXP46100 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATRXP46100 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATRXP46100 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATRXP46100 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATRXP46100 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATRXP46100 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATRXP46100 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATRXP46100 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATRXP46100 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATRXP46100 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATRXP46100 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATRXP46100 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATRXP46100 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ATRXP46100 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ATRXP46100 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATRXP46100 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATRXP46100 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATRXP46100 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATRXP46100 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATRXP46100 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATRXP46100 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATRXP46100 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATRXP46100 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATRXP46100 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATRXP46100 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATRXP46100 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATRXP46100 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATRXP46100 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATRXP46100 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATRXP46100 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATRXP46100 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATRXP46100 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATRXP46100 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATRXP46100 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATRXP46100 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATRXP46100 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATRXP46100 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATRXP46100 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATRXP46100 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATRXP46100 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATRXP46100 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATRXP46100 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATRXP46100 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATRXP46100 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATRXP46100 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATRXP46100 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATRXP46100 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATRXP46100 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATRXP46100 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATRXP46100 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATRXP46100 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATRXP46100 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATRXP46100 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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