Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM23P36406 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms