Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHI3L1P36222 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHI3L1P36222 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHI3L1P36222 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHI3L1P36222 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHI3L1P36222 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHI3L1P36222 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHI3L1P36222 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHI3L1P36222 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHI3L1P36222 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHI3L1P36222 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHI3L1P36222 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHI3L1P36222 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHI3L1P36222 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHI3L1P36222 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHI3L1P36222 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHI3L1P36222 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHI3L1P36222 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHI3L1P36222 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHI3L1P36222 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHI3L1P36222 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHI3L1P36222 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHI3L1P36222 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CHI3L1P36222 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHI3L1P36222 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHI3L1P36222 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHI3L1P36222 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHI3L1P36222 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CHI3L1P36222 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHI3L1P36222 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHI3L1P36222 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHI3L1P36222 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHI3L1P36222 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHI3L1P36222 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHI3L1P36222 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CHI3L1P36222 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHI3L1P36222 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHI3L1P36222 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHI3L1P36222 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHI3L1P36222 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHI3L1P36222 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHI3L1P36222 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHI3L1P36222 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHI3L1P36222 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHI3L1P36222 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHI3L1P36222 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHI3L1P36222 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CHI3L1P36222 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CHI3L1P36222 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CHI3L1P36222 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CHI3L1P36222 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CHI3L1P36222 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CHI3L1P36222 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CHI3L1P36222 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CHI3L1P36222 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CHI3L1P36222 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CHI3L1P36222 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHI3L1P36222 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHI3L1P36222 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHI3L1P36222 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHI3L1P36222 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHI3L1P36222 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHI3L1P36222 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHI3L1P36222 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CHI3L1P36222 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHI3L1P36222 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHI3L1P36222 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHI3L1P36222 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHI3L1P36222 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHI3L1P36222 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CHI3L1P36222 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHI3L1P36222 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHI3L1P36222 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHI3L1P36222 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHI3L1P36222 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHI3L1P36222 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHI3L1P36222 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CHI3L1P36222 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHI3L1P36222 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHI3L1P36222 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHI3L1P36222 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHI3L1P36222 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHI3L1P36222 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CHI3L1P36222 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHI3L1P36222 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHI3L1P36222 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHI3L1P36222 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHI3L1P36222 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHI3L1P36222 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CHI3L1P36222 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHI3L1P36222 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHI3L1P36222 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHI3L1P36222 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHI3L1P36222 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CHI3L1P36222 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHI3L1P36222 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHI3L1P36222 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHI3L1P36222 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHI3L1P36222 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHI3L1P36222 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms