Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms