Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCKARP32238 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCKARP32238 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCKARP32238 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCKARP32238 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCKARP32238 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCKARP32238 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCKARP32238 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCKARP32238 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCKARP32238 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCKARP32238 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCKARP32238 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCKARP32238 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCKARP32238 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCKARP32238 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCKARP32238 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCKARP32238 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCKARP32238 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCKARP32238 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCKARP32238 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCKARP32238 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCKARP32238 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCKARP32238 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCKARP32238 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCKARP32238 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCKARP32238 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCKARP32238 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCKARP32238 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCKARP32238 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCKARP32238 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCKARP32238 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCKARP32238 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCKARP32238 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCKARP32238 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCKARP32238 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCKARP32238 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCKARP32238 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCKARP32238 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCKARP32238 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCKARP32238 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCKARP32238 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCKARP32238 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCKARP32238 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCKARP32238 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCKARP32238 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCKARP32238 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCKARP32238 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCKARP32238 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCKARP32238 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCKARP32238 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCKARP32238 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCKARP32238 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCKARP32238 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCKARP32238 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCKARP32238 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCKARP32238 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCKARP32238 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCKARP32238 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCKARP32238 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCKARP32238 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCKARP32238 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCKARP32238 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCKARP32238 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCKARP32238 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCKARP32238 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCKARP32238 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCKARP32238 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCKARP32238 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCKARP32238 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCKARP32238 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCKARP32238 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCKARP32238 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCKARP32238 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCKARP32238 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCKARP32238 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCKARP32238 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCKARP32238 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCKARP32238 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCKARP32238 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCKARP32238 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCKARP32238 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCKARP32238 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCKARP32238 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCKARP32238 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCKARP32238 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCKARP32238 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCKARP32238 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCKARP32238 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCKARP32238 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCKARP32238 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCKARP32238 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCKARP32238 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCKARP32238 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCKARP32238 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCKARP32238 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCKARP32238 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCKARP32238 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCKARP32238 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCKARP32238 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCKARP32238 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms