Protein–RNA interactions for Protein: P29400

COL4A5, Collagen alpha-5(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A5P29400 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL4A5P29400 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL4A5P29400 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL4A5P29400 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL4A5P29400 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL4A5P29400 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL4A5P29400 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL4A5P29400 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL4A5P29400 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL4A5P29400 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL4A5P29400 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL4A5P29400 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL4A5P29400 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL4A5P29400 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL4A5P29400 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL4A5P29400 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL4A5P29400 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL4A5P29400 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL4A5P29400 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL4A5P29400 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL4A5P29400 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL4A5P29400 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL4A5P29400 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL4A5P29400 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL4A5P29400 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL4A5P29400 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL4A5P29400 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
COL4A5P29400 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
COL4A5P29400 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
COL4A5P29400 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL4A5P29400 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL4A5P29400 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
COL4A5P29400 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL4A5P29400 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
COL4A5P29400 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL4A5P29400 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL4A5P29400 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL4A5P29400 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL4A5P29400 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL4A5P29400 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL4A5P29400 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL4A5P29400 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL4A5P29400 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL4A5P29400 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL4A5P29400 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL4A5P29400 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL4A5P29400 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL4A5P29400 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL4A5P29400 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL4A5P29400 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL4A5P29400 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
COL4A5P29400 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
COL4A5P29400 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
COL4A5P29400 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
COL4A5P29400 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
COL4A5P29400 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
COL4A5P29400 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
COL4A5P29400 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.15
COL4A5P29400 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
COL4A5P29400 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
COL4A5P29400 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
COL4A5P29400 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms