Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms