Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PLNP26678 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PLNP26678 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PLNP26678 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PLNP26678 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PLNP26678 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PLNP26678 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PLNP26678 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PLNP26678 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PLNP26678 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PLNP26678 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PLNP26678 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PLNP26678 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PLNP26678 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PLNP26678 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PLNP26678 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PLNP26678 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PLNP26678 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PLNP26678 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PLNP26678 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PLNP26678 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PLNP26678 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PLNP26678 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PLNP26678 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PLNP26678 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PLNP26678 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PLNP26678 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PLNP26678 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PLNP26678 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PLNP26678 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PLNP26678 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PLNP26678 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PLNP26678 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PLNP26678 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PLNP26678 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PLNP26678 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PLNP26678 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PLNP26678 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PLNP26678 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PLNP26678 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PLNP26678 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PLNP26678 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PLNP26678 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PLNP26678 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PLNP26678 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PLNP26678 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PLNP26678 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PLNP26678 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PLNP26678 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PLNP26678 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PLNP26678 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PLNP26678 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PLNP26678 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PLNP26678 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PLNP26678 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PLNP26678 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PLNP26678 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PLNP26678 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PLNP26678 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PLNP26678 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PLNP26678 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PLNP26678 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PLNP26678 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PLNP26678 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PLNP26678 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PLNP26678 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PLNP26678 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PLNP26678 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PLNP26678 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PLNP26678 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PLNP26678 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PLNP26678 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PLNP26678 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PLNP26678 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PLNP26678 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PLNP26678 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PLNP26678 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PLNP26678 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PLNP26678 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PLNP26678 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PLNP26678 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PLNP26678 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PLNP26678 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PLNP26678 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PLNP26678 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PLNP26678 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PLNP26678 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PLNP26678 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PLNP26678 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PLNP26678 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PLNP26678 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PLNP26678 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PLNP26678 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PLNP26678 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PLNP26678 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PLNP26678 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PLNP26678 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PLNP26678 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PLNP26678 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PLNP26678 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms