Protein–RNA interactions for Protein: P23634

ATP2B4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B4P23634 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ATP2B4P23634 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP2B4P23634 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms