Protein–RNA interactions for Protein: P19447

ERCC3, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPB subunit, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC3P19447 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERCC3P19447 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERCC3P19447 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERCC3P19447 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERCC3P19447 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERCC3P19447 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERCC3P19447 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ERCC3P19447 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERCC3P19447 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERCC3P19447 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERCC3P19447 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERCC3P19447 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERCC3P19447 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERCC3P19447 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ERCC3P19447 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERCC3P19447 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERCC3P19447 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERCC3P19447 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERCC3P19447 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERCC3P19447 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERCC3P19447 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERCC3P19447 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERCC3P19447 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ERCC3P19447 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERCC3P19447 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERCC3P19447 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERCC3P19447 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERCC3P19447 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERCC3P19447 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERCC3P19447 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERCC3P19447 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERCC3P19447 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERCC3P19447 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERCC3P19447 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERCC3P19447 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERCC3P19447 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERCC3P19447 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERCC3P19447 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERCC3P19447 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ERCC3P19447 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERCC3P19447 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERCC3P19447 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERCC3P19447 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERCC3P19447 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERCC3P19447 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERCC3P19447 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERCC3P19447 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERCC3P19447 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ERCC3P19447 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERCC3P19447 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERCC3P19447 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERCC3P19447 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERCC3P19447 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERCC3P19447 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERCC3P19447 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERCC3P19447 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERCC3P19447 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERCC3P19447 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERCC3P19447 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERCC3P19447 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERCC3P19447 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERCC3P19447 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERCC3P19447 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERCC3P19447 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ERCC3P19447 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERCC3P19447 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERCC3P19447 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ERCC3P19447 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERCC3P19447 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERCC3P19447 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERCC3P19447 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERCC3P19447 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERCC3P19447 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERCC3P19447 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERCC3P19447 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERCC3P19447 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERCC3P19447 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERCC3P19447 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERCC3P19447 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERCC3P19447 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERCC3P19447 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERCC3P19447 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERCC3P19447 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERCC3P19447 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERCC3P19447 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERCC3P19447 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERCC3P19447 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERCC3P19447 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERCC3P19447 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERCC3P19447 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERCC3P19447 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERCC3P19447 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERCC3P19447 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERCC3P19447 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERCC3P19447 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ERCC3P19447 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERCC3P19447 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERCC3P19447 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERCC3P19447 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERCC3P19447 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms