Protein–RNA interactions for Protein: P17655

CAPN2, Calpain-2 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN2P17655 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAPN2P17655 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAPN2P17655 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAPN2P17655 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CAPN2P17655 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAPN2P17655 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAPN2P17655 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CAPN2P17655 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CAPN2P17655 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAPN2P17655 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CAPN2P17655 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CAPN2P17655 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CAPN2P17655 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAPN2P17655 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAPN2P17655 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CAPN2P17655 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CAPN2P17655 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CAPN2P17655 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CAPN2P17655 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAPN2P17655 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CAPN2P17655 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAPN2P17655 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAPN2P17655 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAPN2P17655 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAPN2P17655 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAPN2P17655 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAPN2P17655 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAPN2P17655 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CAPN2P17655 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CAPN2P17655 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CAPN2P17655 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CAPN2P17655 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAPN2P17655 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAPN2P17655 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAPN2P17655 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAPN2P17655 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAPN2P17655 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAPN2P17655 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAPN2P17655 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAPN2P17655 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CAPN2P17655 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAPN2P17655 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAPN2P17655 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAPN2P17655 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAPN2P17655 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CAPN2P17655 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAPN2P17655 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CAPN2P17655 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAPN2P17655 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CAPN2P17655 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CAPN2P17655 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CAPN2P17655 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CAPN2P17655 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAPN2P17655 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAPN2P17655 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CAPN2P17655 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAPN2P17655 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CAPN2P17655 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAPN2P17655 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CAPN2P17655 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CAPN2P17655 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CAPN2P17655 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAPN2P17655 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAPN2P17655 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAPN2P17655 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CAPN2P17655 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAPN2P17655 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAPN2P17655 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CAPN2P17655 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAPN2P17655 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAPN2P17655 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CAPN2P17655 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CAPN2P17655 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CAPN2P17655 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CAPN2P17655 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CAPN2P17655 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CAPN2P17655 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CAPN2P17655 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CAPN2P17655 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CAPN2P17655 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CAPN2P17655 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CAPN2P17655 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CAPN2P17655 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CAPN2P17655 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CAPN2P17655 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CAPN2P17655 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CAPN2P17655 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CAPN2P17655 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CAPN2P17655 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CAPN2P17655 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
CAPN2P17655 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CAPN2P17655 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
CAPN2P17655 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CAPN2P17655 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CAPN2P17655 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CAPN2P17655 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CAPN2P17655 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CAPN2P17655 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CAPN2P17655 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CAPN2P17655 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms