Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms