Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRF1P14222 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRF1P14222 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PRF1P14222 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRF1P14222 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRF1P14222 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRF1P14222 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRF1P14222 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRF1P14222 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRF1P14222 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PRF1P14222 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PRF1P14222 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PRF1P14222 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRF1P14222 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRF1P14222 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRF1P14222 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRF1P14222 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRF1P14222 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRF1P14222 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRF1P14222 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRF1P14222 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRF1P14222 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRF1P14222 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRF1P14222 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRF1P14222 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRF1P14222 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRF1P14222 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRF1P14222 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRF1P14222 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRF1P14222 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRF1P14222 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRF1P14222 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRF1P14222 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRF1P14222 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRF1P14222 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRF1P14222 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRF1P14222 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRF1P14222 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRF1P14222 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRF1P14222 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRF1P14222 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRF1P14222 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRF1P14222 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRF1P14222 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRF1P14222 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRF1P14222 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRF1P14222 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRF1P14222 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRF1P14222 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRF1P14222 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRF1P14222 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRF1P14222 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PRF1P14222 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PRF1P14222 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PRF1P14222 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PRF1P14222 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PRF1P14222 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PRF1P14222 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PRF1P14222 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PRF1P14222 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PRF1P14222 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PRF1P14222 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PRF1P14222 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PRF1P14222 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PRF1P14222 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PRF1P14222 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PRF1P14222 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PRF1P14222 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PRF1P14222 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PRF1P14222 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PRF1P14222 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PRF1P14222 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PRF1P14222 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PRF1P14222 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PRF1P14222 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PRF1P14222 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PRF1P14222 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PRF1P14222 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PRF1P14222 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
PRF1P14222 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRF1P14222 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRF1P14222 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRF1P14222 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRF1P14222 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRF1P14222 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRF1P14222 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRF1P14222 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRF1P14222 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRF1P14222 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRF1P14222 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRF1P14222 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRF1P14222 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRF1P14222 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRF1P14222 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRF1P14222 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PRF1P14222 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRF1P14222 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRF1P14222 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRF1P14222 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRF1P14222 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms