Protein–RNA interactions for Protein: P11055

MYH3, Myosin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,940 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH3P11055 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYH3P11055 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYH3P11055 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYH3P11055 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYH3P11055 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYH3P11055 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYH3P11055 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYH3P11055 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYH3P11055 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYH3P11055 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYH3P11055 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYH3P11055 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYH3P11055 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MYH3P11055 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MYH3P11055 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MYH3P11055 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYH3P11055 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYH3P11055 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYH3P11055 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYH3P11055 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYH3P11055 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYH3P11055 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYH3P11055 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MYH3P11055 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYH3P11055 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYH3P11055 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYH3P11055 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYH3P11055 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MYH3P11055 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYH3P11055 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYH3P11055 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYH3P11055 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYH3P11055 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYH3P11055 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYH3P11055 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYH3P11055 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYH3P11055 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYH3P11055 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYH3P11055 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYH3P11055 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYH3P11055 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYH3P11055 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYH3P11055 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYH3P11055 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYH3P11055 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYH3P11055 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYH3P11055 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYH3P11055 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYH3P11055 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYH3P11055 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYH3P11055 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYH3P11055 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYH3P11055 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYH3P11055 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYH3P11055 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYH3P11055 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYH3P11055 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYH3P11055 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MYH3P11055 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYH3P11055 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYH3P11055 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYH3P11055 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYH3P11055 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYH3P11055 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYH3P11055 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYH3P11055 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYH3P11055 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYH3P11055 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYH3P11055 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MYH3P11055 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYH3P11055 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYH3P11055 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYH3P11055 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYH3P11055 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYH3P11055 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYH3P11055 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYH3P11055 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYH3P11055 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYH3P11055 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MYH3P11055 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYH3P11055 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYH3P11055 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYH3P11055 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MYH3P11055 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYH3P11055 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYH3P11055 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYH3P11055 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYH3P11055 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MYH3P11055 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MYH3P11055 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
MYH3P11055 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MYH3P11055 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
MYH3P11055 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MYH3P11055 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
MYH3P11055 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYH3P11055 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYH3P11055 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYH3P11055 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYH3P11055 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYH3P11055 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms