Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CHGAP10645 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CHGAP10645 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CHGAP10645 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CHGAP10645 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CHGAP10645 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CHGAP10645 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CHGAP10645 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CHGAP10645 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CHGAP10645 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CHGAP10645 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHGAP10645 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHGAP10645 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHGAP10645 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHGAP10645 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHGAP10645 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHGAP10645 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHGAP10645 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHGAP10645 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHGAP10645 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHGAP10645 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHGAP10645 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHGAP10645 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHGAP10645 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHGAP10645 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHGAP10645 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHGAP10645 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHGAP10645 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHGAP10645 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHGAP10645 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHGAP10645 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHGAP10645 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHGAP10645 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHGAP10645 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHGAP10645 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHGAP10645 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHGAP10645 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CHGAP10645 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHGAP10645 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHGAP10645 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHGAP10645 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CHGAP10645 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHGAP10645 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CHGAP10645 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHGAP10645 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHGAP10645 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHGAP10645 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHGAP10645 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHGAP10645 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHGAP10645 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHGAP10645 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHGAP10645 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHGAP10645 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHGAP10645 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHGAP10645 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHGAP10645 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHGAP10645 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHGAP10645 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHGAP10645 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHGAP10645 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CHGAP10645 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHGAP10645 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHGAP10645 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHGAP10645 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CHGAP10645 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHGAP10645 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHGAP10645 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHGAP10645 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHGAP10645 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHGAP10645 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHGAP10645 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CHGAP10645 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHGAP10645 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHGAP10645 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHGAP10645 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHGAP10645 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHGAP10645 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHGAP10645 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHGAP10645 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHGAP10645 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHGAP10645 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHGAP10645 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHGAP10645 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHGAP10645 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHGAP10645 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHGAP10645 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CHGAP10645 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHGAP10645 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHGAP10645 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHGAP10645 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHGAP10645 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHGAP10645 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHGAP10645 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHGAP10645 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHGAP10645 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHGAP10645 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHGAP10645 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHGAP10645 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHGAP10645 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHGAP10645 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms