Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
C4BP0C0L5 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105 ms