Protein–RNA interactions for Protein: P07951

TPM2, Tropomyosin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM2P07951 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TPM2P07951 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TPM2P07951 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TPM2P07951 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPM2P07951 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPM2P07951 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPM2P07951 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPM2P07951 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPM2P07951 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPM2P07951 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPM2P07951 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPM2P07951 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPM2P07951 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPM2P07951 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPM2P07951 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPM2P07951 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPM2P07951 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPM2P07951 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPM2P07951 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPM2P07951 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPM2P07951 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TPM2P07951 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPM2P07951 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPM2P07951 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPM2P07951 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPM2P07951 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPM2P07951 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPM2P07951 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPM2P07951 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPM2P07951 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPM2P07951 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPM2P07951 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPM2P07951 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPM2P07951 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPM2P07951 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPM2P07951 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPM2P07951 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPM2P07951 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPM2P07951 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPM2P07951 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TPM2P07951 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TPM2P07951 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TPM2P07951 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TPM2P07951 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TPM2P07951 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TPM2P07951 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TPM2P07951 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TPM2P07951 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TPM2P07951 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TPM2P07951 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TPM2P07951 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TPM2P07951 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TPM2P07951 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TPM2P07951 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TPM2P07951 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TPM2P07951 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TPM2P07951 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TPM2P07951 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TPM2P07951 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TPM2P07951 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TPM2P07951 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TPM2P07951 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TPM2P07951 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TPM2P07951 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TPM2P07951 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TPM2P07951 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TPM2P07951 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
TPM2P07951 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TPM2P07951 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TPM2P07951 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TPM2P07951 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TPM2P07951 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPM2P07951 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPM2P07951 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPM2P07951 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPM2P07951 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPM2P07951 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPM2P07951 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPM2P07951 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPM2P07951 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPM2P07951 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPM2P07951 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPM2P07951 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPM2P07951 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPM2P07951 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TPM2P07951 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPM2P07951 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPM2P07951 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPM2P07951 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPM2P07951 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TPM2P07951 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPM2P07951 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPM2P07951 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPM2P07951 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPM2P07951 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPM2P07951 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPM2P07951 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPM2P07951 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPM2P07951 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TPM2P07951 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms