Protein–RNA interactions for Protein: P06493

CDK1, Cyclin-dependent kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK1P06493 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK1P06493 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK1P06493 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK1P06493 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK1P06493 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK1P06493 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK1P06493 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK1P06493 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK1P06493 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK1P06493 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK1P06493 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK1P06493 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK1P06493 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK1P06493 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK1P06493 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK1P06493 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK1P06493 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK1P06493 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK1P06493 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK1P06493 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK1P06493 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK1P06493 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK1P06493 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK1P06493 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK1P06493 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK1P06493 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK1P06493 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK1P06493 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK1P06493 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK1P06493 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK1P06493 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK1P06493 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK1P06493 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK1P06493 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK1P06493 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK1P06493 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK1P06493 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK1P06493 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK1P06493 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK1P06493 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK1P06493 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK1P06493 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK1P06493 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK1P06493 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK1P06493 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK1P06493 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK1P06493 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK1P06493 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK1P06493 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK1P06493 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK1P06493 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK1P06493 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK1P06493 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK1P06493 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK1P06493 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK1P06493 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK1P06493 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK1P06493 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK1P06493 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK1P06493 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK1P06493 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK1P06493 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK1P06493 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK1P06493 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK1P06493 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK1P06493 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK1P06493 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK1P06493 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK1P06493 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK1P06493 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK1P06493 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK1P06493 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK1P06493 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK1P06493 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK1P06493 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK1P06493 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK1P06493 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK1P06493 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK1P06493 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK1P06493 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK1P06493 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK1P06493 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK1P06493 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK1P06493 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK1P06493 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK1P06493 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK1P06493 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK1P06493 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK1P06493 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK1P06493 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK1P06493 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK1P06493 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK1P06493 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK1P06493 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK1P06493 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK1P06493 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK1P06493 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK1P06493 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK1P06493 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK1P06493 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms