Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms