Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
EGFRP00533 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EGFRP00533 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EGFRP00533 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EGFRP00533 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EGFRP00533 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EGFRP00533 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EGFRP00533 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
EGFRP00533 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EGFRP00533 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EGFRP00533 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EGFRP00533 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EGFRP00533 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EGFRP00533 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
EGFRP00533 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EGFRP00533 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EGFRP00533 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EGFRP00533 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EGFRP00533 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EGFRP00533 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EGFRP00533 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EGFRP00533 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EGFRP00533 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EGFRP00533 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EGFRP00533 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EGFRP00533 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
EGFRP00533 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EGFRP00533 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EGFRP00533 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
EGFRP00533 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EGFRP00533 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
EGFRP00533 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EGFRP00533 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EGFRP00533 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EGFRP00533 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EGFRP00533 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EGFRP00533 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EGFRP00533 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EGFRP00533 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EGFRP00533 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EGFRP00533 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EGFRP00533 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EGFRP00533 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EGFRP00533 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EGFRP00533 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EGFRP00533 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EGFRP00533 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EGFRP00533 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
EGFRP00533 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EGFRP00533 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EGFRP00533 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EGFRP00533 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EGFRP00533 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
EGFRP00533 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EGFRP00533 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EGFRP00533 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EGFRP00533 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EGFRP00533 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EGFRP00533 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EGFRP00533 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EGFRP00533 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EGFRP00533 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EGFRP00533 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EGFRP00533 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EGFRP00533 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EGFRP00533 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EGFRP00533 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EGFRP00533 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EGFRP00533 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EGFRP00533 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
EGFRP00533 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EGFRP00533 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EGFRP00533 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EGFRP00533 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EGFRP00533 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EGFRP00533 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EGFRP00533 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EGFRP00533 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
EGFRP00533 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EGFRP00533 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EGFRP00533 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EGFRP00533 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EGFRP00533 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EGFRP00533 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EGFRP00533 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EGFRP00533 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EGFRP00533 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EGFRP00533 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EGFRP00533 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EGFRP00533 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EGFRP00533 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EGFRP00533 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EGFRP00533 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EGFRP00533 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EGFRP00533 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EGFRP00533 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
EGFRP00533 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EGFRP00533 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EGFRP00533 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EGFRP00533 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms