Protein–RNA interactions for Protein: O95562

SFT2D2, Vesicle transport protein SFT2B, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D2O95562 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms