Protein–RNA interactions for Protein: O94813

SLIT2, Slit homolog 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIT2O94813 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLIT2O94813 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLIT2O94813 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLIT2O94813 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLIT2O94813 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLIT2O94813 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLIT2O94813 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLIT2O94813 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLIT2O94813 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLIT2O94813 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLIT2O94813 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLIT2O94813 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLIT2O94813 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLIT2O94813 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLIT2O94813 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLIT2O94813 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLIT2O94813 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLIT2O94813 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLIT2O94813 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLIT2O94813 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLIT2O94813 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLIT2O94813 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLIT2O94813 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SLIT2O94813 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLIT2O94813 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLIT2O94813 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLIT2O94813 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLIT2O94813 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLIT2O94813 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLIT2O94813 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLIT2O94813 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLIT2O94813 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLIT2O94813 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLIT2O94813 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLIT2O94813 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLIT2O94813 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLIT2O94813 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SLIT2O94813 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLIT2O94813 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SLIT2O94813 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLIT2O94813 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SLIT2O94813 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLIT2O94813 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLIT2O94813 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLIT2O94813 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLIT2O94813 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLIT2O94813 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLIT2O94813 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLIT2O94813 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLIT2O94813 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLIT2O94813 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLIT2O94813 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLIT2O94813 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLIT2O94813 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLIT2O94813 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLIT2O94813 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLIT2O94813 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLIT2O94813 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLIT2O94813 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLIT2O94813 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLIT2O94813 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLIT2O94813 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SLIT2O94813 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SLIT2O94813 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SLIT2O94813 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLIT2O94813 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLIT2O94813 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLIT2O94813 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLIT2O94813 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SLIT2O94813 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLIT2O94813 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLIT2O94813 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLIT2O94813 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLIT2O94813 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLIT2O94813 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLIT2O94813 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLIT2O94813 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLIT2O94813 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLIT2O94813 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLIT2O94813 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLIT2O94813 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLIT2O94813 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLIT2O94813 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLIT2O94813 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SLIT2O94813 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLIT2O94813 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLIT2O94813 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLIT2O94813 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLIT2O94813 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLIT2O94813 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLIT2O94813 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLIT2O94813 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLIT2O94813 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLIT2O94813 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLIT2O94813 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLIT2O94813 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLIT2O94813 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SLIT2O94813 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLIT2O94813 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLIT2O94813 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms