Protein–RNA interactions for Protein: O75936

BBOX1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOX1O75936 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BBOX1O75936 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
BBOX1O75936 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
BBOX1O75936 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
BBOX1O75936 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
BBOX1O75936 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
BBOX1O75936 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
BBOX1O75936 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BBOX1O75936 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BBOX1O75936 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BBOX1O75936 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BBOX1O75936 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BBOX1O75936 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BBOX1O75936 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BBOX1O75936 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BBOX1O75936 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BBOX1O75936 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BBOX1O75936 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BBOX1O75936 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BBOX1O75936 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BBOX1O75936 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
BBOX1O75936 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BBOX1O75936 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BBOX1O75936 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BBOX1O75936 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BBOX1O75936 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BBOX1O75936 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BBOX1O75936 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BBOX1O75936 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BBOX1O75936 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BBOX1O75936 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BBOX1O75936 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BBOX1O75936 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BBOX1O75936 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BBOX1O75936 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BBOX1O75936 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BBOX1O75936 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms