Protein–RNA interactions for Protein: O75822

EIF3J, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3JO75822 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.28■■□□□ 1
EIF3JO75822 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EIF3JO75822 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EIF3JO75822 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EIF3JO75822 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EIF3JO75822 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EIF3JO75822 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EIF3JO75822 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
EIF3JO75822 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.28■■□□□ 1
EIF3JO75822 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC21.28■■□□□ 1
EIF3JO75822 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EIF3JO75822 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.28■■□□□ 1
EIF3JO75822 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
EIF3JO75822 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EIF3JO75822 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
EIF3JO75822 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EIF3JO75822 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EIF3JO75822 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EIF3JO75822 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EIF3JO75822 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
EIF3JO75822 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EIF3JO75822 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.27■■□□□ 1
EIF3JO75822 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
EIF3JO75822 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EIF3JO75822 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
EIF3JO75822 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
EIF3JO75822 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EIF3JO75822 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EIF3JO75822 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EIF3JO75822 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EIF3JO75822 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EIF3JO75822 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EIF3JO75822 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
EIF3JO75822 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EIF3JO75822 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EIF3JO75822 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EIF3JO75822 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EIF3JO75822 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EIF3JO75822 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
EIF3JO75822 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
EIF3JO75822 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
EIF3JO75822 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
EIF3JO75822 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EIF3JO75822 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EIF3JO75822 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EIF3JO75822 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EIF3JO75822 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EIF3JO75822 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EIF3JO75822 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EIF3JO75822 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EIF3JO75822 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EIF3JO75822 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EIF3JO75822 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
EIF3JO75822 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EIF3JO75822 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EIF3JO75822 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EIF3JO75822 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EIF3JO75822 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EIF3JO75822 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EIF3JO75822 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF3JO75822 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF3JO75822 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF3JO75822 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF3JO75822 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF3JO75822 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF3JO75822 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF3JO75822 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF3JO75822 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF3JO75822 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF3JO75822 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF3JO75822 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF3JO75822 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF3JO75822 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF3JO75822 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF3JO75822 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF3JO75822 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF3JO75822 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF3JO75822 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF3JO75822 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF3JO75822 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF3JO75822 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF3JO75822 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF3JO75822 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF3JO75822 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF3JO75822 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF3JO75822 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF3JO75822 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF3JO75822 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF3JO75822 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF3JO75822 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF3JO75822 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF3JO75822 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF3JO75822 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EIF3JO75822 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EIF3JO75822 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EIF3JO75822 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EIF3JO75822 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EIF3JO75822 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EIF3JO75822 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EIF3JO75822 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms