Protein–RNA interactions for Protein: O60934

NBN, Nibrin, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBNO60934 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NBNO60934 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NBNO60934 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NBNO60934 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NBNO60934 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NBNO60934 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NBNO60934 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NBNO60934 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NBNO60934 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NBNO60934 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NBNO60934 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NBNO60934 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NBNO60934 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NBNO60934 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NBNO60934 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NBNO60934 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NBNO60934 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NBNO60934 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NBNO60934 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NBNO60934 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NBNO60934 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NBNO60934 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NBNO60934 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NBNO60934 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NBNO60934 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NBNO60934 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NBNO60934 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NBNO60934 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NBNO60934 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NBNO60934 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NBNO60934 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NBNO60934 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NBNO60934 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NBNO60934 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NBNO60934 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NBNO60934 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NBNO60934 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NBNO60934 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NBNO60934 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NBNO60934 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NBNO60934 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NBNO60934 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NBNO60934 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NBNO60934 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NBNO60934 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NBNO60934 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NBNO60934 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NBNO60934 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NBNO60934 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NBNO60934 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NBNO60934 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NBNO60934 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NBNO60934 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NBNO60934 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NBNO60934 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NBNO60934 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NBNO60934 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NBNO60934 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NBNO60934 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NBNO60934 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NBNO60934 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NBNO60934 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NBNO60934 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NBNO60934 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NBNO60934 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NBNO60934 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NBNO60934 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NBNO60934 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NBNO60934 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NBNO60934 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NBNO60934 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NBNO60934 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NBNO60934 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NBNO60934 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NBNO60934 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NBNO60934 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NBNO60934 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NBNO60934 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NBNO60934 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NBNO60934 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NBNO60934 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NBNO60934 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NBNO60934 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NBNO60934 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NBNO60934 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NBNO60934 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NBNO60934 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NBNO60934 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NBNO60934 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NBNO60934 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NBNO60934 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NBNO60934 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NBNO60934 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NBNO60934 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NBNO60934 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NBNO60934 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NBNO60934 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NBNO60934 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NBNO60934 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NBNO60934 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms