Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SPAG9O60271 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SPAG9O60271 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SPAG9O60271 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SPAG9O60271 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SPAG9O60271 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SPAG9O60271 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SPAG9O60271 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SPAG9O60271 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SPAG9O60271 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SPAG9O60271 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
SPAG9O60271 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SPAG9O60271 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SPAG9O60271 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SPAG9O60271 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SPAG9O60271 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SPAG9O60271 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SPAG9O60271 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
SPAG9O60271 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SPAG9O60271 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
SPAG9O60271 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SPAG9O60271 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SPAG9O60271 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SPAG9O60271 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SPAG9O60271 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SPAG9O60271 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SPAG9O60271 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SPAG9O60271 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SPAG9O60271 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SPAG9O60271 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SPAG9O60271 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SPAG9O60271 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SPAG9O60271 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SPAG9O60271 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SPAG9O60271 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
SPAG9O60271 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SPAG9O60271 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SPAG9O60271 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SPAG9O60271 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
SPAG9O60271 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SPAG9O60271 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SPAG9O60271 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SPAG9O60271 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SPAG9O60271 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SPAG9O60271 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SPAG9O60271 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SPAG9O60271 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SPAG9O60271 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SPAG9O60271 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SPAG9O60271 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SPAG9O60271 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SPAG9O60271 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SPAG9O60271 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
SPAG9O60271 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SPAG9O60271 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SPAG9O60271 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SPAG9O60271 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SPAG9O60271 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SPAG9O60271 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SPAG9O60271 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SPAG9O60271 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
SPAG9O60271 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SPAG9O60271 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SPAG9O60271 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SPAG9O60271 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SPAG9O60271 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SPAG9O60271 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SPAG9O60271 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SPAG9O60271 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SPAG9O60271 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SPAG9O60271 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SPAG9O60271 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SPAG9O60271 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SPAG9O60271 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SPAG9O60271 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SPAG9O60271 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
SPAG9O60271 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SPAG9O60271 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SPAG9O60271 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SPAG9O60271 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
SPAG9O60271 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SPAG9O60271 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SPAG9O60271 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
SPAG9O60271 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
SPAG9O60271 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SPAG9O60271 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SPAG9O60271 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SPAG9O60271 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SPAG9O60271 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
SPAG9O60271 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SPAG9O60271 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SPAG9O60271 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SPAG9O60271 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SPAG9O60271 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SPAG9O60271 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SPAG9O60271 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SPAG9O60271 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SPAG9O60271 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SPAG9O60271 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SPAG9O60271 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.1 ms