Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms