Protein–RNA interactions for Protein: O43255

SIAH2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIAH2O43255 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIAH2O43255 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms