Protein–RNA interactions for Protein: O15550

KDM6A, Lysine-specific demethylase 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6AO15550 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KDM6AO15550 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KDM6AO15550 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
KDM6AO15550 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KDM6AO15550 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KDM6AO15550 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KDM6AO15550 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KDM6AO15550 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KDM6AO15550 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KDM6AO15550 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KDM6AO15550 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KDM6AO15550 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM6AO15550 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM6AO15550 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM6AO15550 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM6AO15550 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM6AO15550 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM6AO15550 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM6AO15550 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM6AO15550 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM6AO15550 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM6AO15550 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM6AO15550 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM6AO15550 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM6AO15550 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM6AO15550 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM6AO15550 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM6AO15550 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM6AO15550 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM6AO15550 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM6AO15550 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM6AO15550 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM6AO15550 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM6AO15550 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM6AO15550 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM6AO15550 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM6AO15550 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM6AO15550 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM6AO15550 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KDM6AO15550 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KDM6AO15550 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KDM6AO15550 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KDM6AO15550 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KDM6AO15550 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KDM6AO15550 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KDM6AO15550 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KDM6AO15550 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KDM6AO15550 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KDM6AO15550 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KDM6AO15550 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KDM6AO15550 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KDM6AO15550 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KDM6AO15550 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KDM6AO15550 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KDM6AO15550 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KDM6AO15550 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM6AO15550 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM6AO15550 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM6AO15550 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM6AO15550 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM6AO15550 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM6AO15550 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM6AO15550 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM6AO15550 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM6AO15550 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM6AO15550 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM6AO15550 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM6AO15550 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM6AO15550 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM6AO15550 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM6AO15550 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM6AO15550 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM6AO15550 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM6AO15550 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM6AO15550 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM6AO15550 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM6AO15550 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM6AO15550 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM6AO15550 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM6AO15550 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM6AO15550 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM6AO15550 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM6AO15550 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM6AO15550 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms