Protein–RNA interactions for Protein: O15240

VGF, Neurosecretory protein VGF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGFO15240 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VGFO15240 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VGFO15240 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VGFO15240 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VGFO15240 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VGFO15240 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VGFO15240 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
VGFO15240 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VGFO15240 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VGFO15240 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VGFO15240 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VGFO15240 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
VGFO15240 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VGFO15240 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VGFO15240 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VGFO15240 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VGFO15240 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
VGFO15240 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
VGFO15240 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
VGFO15240 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
VGFO15240 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
VGFO15240 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
VGFO15240 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
VGFO15240 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VGFO15240 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VGFO15240 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VGFO15240 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VGFO15240 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VGFO15240 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VGFO15240 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VGFO15240 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
VGFO15240 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
VGFO15240 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
VGFO15240 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VGFO15240 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
VGFO15240 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
VGFO15240 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
VGFO15240 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
VGFO15240 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
VGFO15240 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
VGFO15240 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
VGFO15240 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
VGFO15240 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
VGFO15240 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
VGFO15240 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VGFO15240 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VGFO15240 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VGFO15240 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VGFO15240 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VGFO15240 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VGFO15240 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VGFO15240 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VGFO15240 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VGFO15240 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VGFO15240 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VGFO15240 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VGFO15240 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VGFO15240 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VGFO15240 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VGFO15240 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VGFO15240 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VGFO15240 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
VGFO15240 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
VGFO15240 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VGFO15240 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VGFO15240 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VGFO15240 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VGFO15240 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VGFO15240 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VGFO15240 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VGFO15240 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
VGFO15240 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
VGFO15240 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VGFO15240 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VGFO15240 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
VGFO15240 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VGFO15240 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
VGFO15240 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VGFO15240 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VGFO15240 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VGFO15240 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VGFO15240 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
VGFO15240 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
VGFO15240 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
VGFO15240 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
VGFO15240 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
VGFO15240 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
VGFO15240 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
VGFO15240 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VGFO15240 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
VGFO15240 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VGFO15240 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
VGFO15240 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
VGFO15240 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
VGFO15240 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VGFO15240 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VGFO15240 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
VGFO15240 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
VGFO15240 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
VGFO15240 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms