Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
PTPRTO14522 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
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