Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2K7ER74 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms